From Metabolomics.JP
Jump to: navigation, search

Iterative Type I PKS Class

The Phylogeny of Ketosynthase Domain of 470 Iterative Type I PKS Genes
Phylogenetic inference was obtained with maximum-parsimony (MP) algorithms with a bootstrap test (1000 pseudo-replicates) in the MEGA package. Consensus sequences are available here. PK-Class-IterativeTypeI.jpg
Category Class Gene IDs
FAS 01.FAS FAS_01  FAS_02  FAS_03  FAS_04  FAS_05  FAS_06  FAS_07  FAS_08  FAS_09  FAS_10   
Bacterial 02.NRPS-PKS(NFC) An14g04850  Bact04  Bact16  Bact18  Fung034  Fung097   
03a_bPR-PKS Bact03  Bact05  Bact43   
03b_bMSAS Bact06  Bact14  Bact17  Bact20  Bact36  Bact42  Bact44   
04.6-MSAS(NFC) ACLA_093660  AFLA_114820  An10g00140  AO090206000074  APar01  Aspe03  ATEG_06275  ATer01  Bact35  Bact37  Bact52  Bact58  Fung002  Fung006  Fung013  Fung035  Fung056  Fung076  Fung087   
05.Mycobacterium_2 Bact23  Bact28  Bact29  Bact31  Bact34  Bact38  Bact39  Bact40  Bact51  Bact55  Bact56  Bact57   
06.Mycobacterium_3 Bact01  Bact02  Bact24  Bact25  Bact26  Bact27  Bact32  Bact33  Bact41  Bact53  Bact54  Bact59   
07.Bacterial_PKS_mixed_species Bact07  Bact08  Bact09  Bact10  Bact11  Bact12  Bact13  Bact19  Bact21  Bact22  Bact30  Bact45  Bact46  Bact47  Bact48  Bact49  Bact50  Bact60  Bact61  Bact62  Bact63  Bact64  Bact65  Bact66  Bact67   
NR-PKS 08.NRPKS_I_(1)_OAS-Like ANIA_07909  Fung020  Fung059  Fung065  Fung066  Fung068  Fung082  Fung099  Fung112  Fung115  Fung119  Fung127  Fung129  Fung131   
09.NRPKS_I(2) ACLA_043310  AFLA_108550  AFUA_4G00210  AFUA_4G14560  AFUB_071800  AFUB_100730  An04g09530  ANIA_00150  AO090023000444  ATEG_02434  ATEG_08451  ATer06  Fung019  Fung029  Fung107  Fung110  Fung113  Fung118  Fung123  Fung124  NFIA_045430  NFIA_101660  NFIA_101810   
10.NRPKS_I(3) AFLA_060020  AFUA_7G00160  AFUB_086700  An11g07310  ANIA_06000  ANIA_07071  AO090701000530  Fung030  Fung088  Fung089  Fung134  NFIA_112240   
11.NRPKS_I(4a)melanin Fung003  Fung004  Fung007  Fung008  Fung010  Fung011  Fung017  Fung018  Fung060  Fung063  Fung067  Fung069  Fung070  Fung079  Fung081  Fung095  Fung096  Fung101  Fung102  Fung108  Fung117  Fung130  Fung132   
11.NRPKS_I(4b)melanin Fung028  Fung061  Fung064  Fung073  Fung106  Fung111   
12.NRPKS_I(5) ATEG_00145  ATer04   
13.NRPKS_I(6) Fung009  Fung120  Fung126   
14.NRPKS_I(7)Pigment-1 ACLA_076490  AFLA_006170  AFUA_2G17600  AFUB_033290  AFum01  AFum02  AFum03  AFum04  AFum05  AFum06  AFum07  An09g05730  ANIA_08209  ANid02  AO090102000545  Fung083  Fung116  Fung122  NFIA_093000   
15.NRPKS_I(8)Pigment-2 AFLA_116220  An03g05440  AO090010000048  ATEG_07500  ATer05  Fung039  Fung051  Fung054  Fung077  Fung090  Fung094  Fung104  Fung114  Fung121   
16.NRPKS_I(9) AFLA_139410  AFla01  AFla02  AFla03  AN7825  ANid01  AO090026000009  AOry01  APar02  APar03  Aspe01  Aspe02  Aspe04  Fung052  Fung057  Fung092  Fung100  Fung109  StcA   
17.NRPKS_I(10) AFLA_082150  AO090005000961  ATEG_06206  Fung038  Fung053  Fung078  Fung091  Fung093  Fung103  Fung105  Fung125   
18.NRPKS_II AFLA_112840  AFUB_079710  AO090023000877  ATEG_07379   
19.NRPKS_III(1) Fung021  Fung032  Fung033   
20.NRPKS_III(2) ACLA_008090  AFLA_127090  AFUA_3G02570  AFum08  An09g01860  ANIA_00523  AO090001000402  ATEG_03432  Fung022  Fung062  Fung074  Fung133  NFIA_003740   
21.NRPKS_III(3) AFLA_116890  An12g02050  ANIA_03386  AO090010000114  ATEG_08662   
22.NRPKS_III(4) AFLA_062860  AFLA_118960  An03g01820  ANIA_01034  ANIA_02032  ANIA_03230  AO090010000404  AO090701000831  ATEG_07661  Fung031  Fung098   
23.NRPKS_III(5) An09g02100  AO090009000131  Fung024   
24.NRPKS_III(6) ACLA_061390  AFUA_8G02350  AFUB_084240  ANIA_06448  ANIA_08383  ATEG_03629  ATEG_10080  Fung023  NFIA_096030   
R-PKS 25.R-PKS_I(1) ACLA_043440  ACLA_055790  AFLA_053870  AFLA_080490  AFLA_105450  AFLA_118940  AFLA_126710  AFUA_1G01010  AFUA_3G14700  AFUB_034520  AFUB_045640  An01g06930  An02g09430  An03g06380  An07g01030  An09g01290  An09g05340  An11g05570  An12g02670  ANIA_03612  ANIA_06431  ANIA_08910  ANIA_09005  AO090005000798  AO090009000071  AO090010000402  AO090038000210  ATEG_06680  ATEG_08172  ATEG_09100  Fung005  Fung027  Fung046  Fung047  NFIA_004080  NFIA_057360  NFIA_062550   
26.R-PKS_I(2) AFLA_137870  AFUA_8G00370  AFUB_086200  An01g01130  An01g06950  An15g05090  ANIA_07084  AO090011000015  AO090026000149  ATEG_01894  ATEG_04718  ATEG_06056  Fung048  Fung049  Fung050  Fung084  NFIA_023490  NFIA_093790  NFIA_093910   
6-MSAS/NRPS-PKS 27.6-MSAS_I ACLA_042410  AFLA_002900  AFUA_6G13930  AFUB_000820  An04g04340  An11g09720  ANIA_01784  AO090102000166  ATEG_09617  NFIA_100520   
28.NRPS-PKS_I AFLA_010000  AO090103000224   
29.NRPS-PKS_II ACLA_077660  An08g03790  An13g02960   
30.NRPS-PKS_III(Equisetin-like) ACLA_023380  AFLA_066980  An14g01910  AO090001000293  Fung036  Fung043  Fung044  Fung055   
31.6-MSAS_II_(lovastatin-like) ACLA_055680  ATEG_09961  ATer03  Fung045  Fung071  LovB   
32.NRPS-PKS_IV ACLA_078660  ACLA_098920  AFUA_1G17740  AFUB_045790   
33.NRPS-PKS_V ACLA_004770  AFLA_066840  AFLA_139490  AFUA_8G00540  AFUB_086030  An02g08290  An11g06460  ANIA_08412  AO090001000277  AOry02  ATEG_00325  CpaA  Fung015  Fung080  Fung086  NFIA_001530  PsoA   
34.NRPS-PKS_VI AFLA_096770  An11g00250  An18g00520  AO090113000209  ATEG_00282   
R-PKS 35.R-PKS_II AN3610.2  ANIA_10430   
36.R-PKS_III An12g07070  An13g02430  AO090020000186  ATEG_07067  Fung016  Fung025  Fung058  Fung128   
37.R-PKS_IV ACLA_063030  AFLA_054090  AFUA_3G01410  AFUB_046990  AO090009000052  ATEG_09088  Fung001  NFIA_002360   
38.R-PKS_V ACLA_061310  ACLA_063870  AFLA_062820  An09g01930  ANIA_01036  ANIA_02035  ANIA_06791  AO090701000826  ATEG_07659  ATEG_09968  ATer02  Fung012  Fung042  Fung072  Fung085   
39.R-PKS_VI ACLA_087700  ACLA_094600  AFLA_005320  AFLA_128060  AFUA_2G01290  AFUB_018370  An02g00450  An03g05140  An04g10030  An11g03920  An15g02130  An15g04140  AO090001000506  AO090038000086  Fung014  Fung037  Fung040  NFIA_033590   
40.R-PKS_VII ACLA_002670  An11g05960  An15g07920  Aspe05  ATEG_03446  ATEG_07279   
41.R-PKS_VIII An11g05940  ATEG_07282  Fung041   
42.R-PKS_IX ACLA_098370  Fung026  Fung075   
43.R-PKS_X An11g04280  An12g02730  AN9217.2  ANIA_02547  ANIA_07838  ANIA_11191   

This category currently contains no pages or media.

Personal tools