Aritalab:Lecture/NetworkBiology
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| − | : 長さ: | + | : 長さ: A4用紙に3枚以上とします。関連する論文を複数扱っても構いません。文献情報を必ずつけてください。 |
: 提出方法： Word または PDF を arita(AT)bi.s.su-tokyo.ac.jp まで送ってください。タイトルに「ネットワーク生物課題」としてください。 | : 提出方法： Word または PDF を arita(AT)bi.s.su-tokyo.ac.jp まで送ってください。タイトルに「ネットワーク生物課題」としてください。 | ||
| + | : 参考 [[http://metabolomics.jp/wiki/Aritalab:Lecture/Basic/Report|レポートの書き方]] | ||
: 〆切: １月１１日 | : 〆切: １月１１日 | ||
* 1/11 [[Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Markov_Chains|マルコフ連鎖]] | * 1/11 [[Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Markov_Chains|マルコフ連鎖]] | ||
Revision as of 08:26, 25 December 2012
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ネットワーク生物学
概要
代謝やシグナル伝達経路から社会、ウェブネットワークに至るまで、様々な実体のネットワークモデルおよびその解析法を概観することを目標とする。 具体的には、最新の研究トピックを適時交えながら、ネットワーク解析の基礎について解説する。以下の数理モデルについて、それぞれ生物学的な例や知見を紹介する。
授業内容
- 11/30 スケールフリー性、バラバシ・アルバートモデル
- 12/7 クラスター係数、平均頂点間距離、エルデシュ・レニイモデル, スモールワールド
- 12/14 リンク解析, ランダムウォーク
- 12/21 休講
- 冬休みの課題
- スケールフリー性、スモールワールド性、ハブ、クラスター等を扱っている生物系の論文を読み、それらの特徴から生物学としてどの様な興味ある結果が得られているかレポートしてください。授業で扱った内容との関連、論文の概要と、考え方の根拠、観測結果の根拠などがわかるように説明をお願いします。
- 長さ: A4用紙に3枚以上とします。関連する論文を複数扱っても構いません。文献情報を必ずつけてください。
- 提出方法： Word または PDF を arita(AT)bi.s.su-tokyo.ac.jp まで送ってください。タイトルに「ネットワーク生物課題」としてください。
- 参考 [[1]]
- 〆切: １月１１日
- 1/11 マルコフ連鎖
- 1/18 パーコレーション, グラフ上のパーコレーション
- 1/25 コンタクトプロセス
- 2/1 出生死亡過程
