Aritalab:Lecture/Bioinformatics

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(=生物機能科学特別講義8 (山口大学)
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; [http://togotv-curated.dbcls.jp/ 統合TV] : 統合データベースセンターが作成する、バイオインフォマティクスのビデオ講義です。ツールの使い方などが丁寧に解説されています。
 
; [http://togotv-curated.dbcls.jp/ 統合TV] : 統合データベースセンターが作成する、バイオインフォマティクスのビデオ講義です。ツールの使い方などが丁寧に解説されています。
 
; [http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r.html Rでマイクロアレイデータ解析] : 東大アグリバイオインフォマティクスの門田先生による解説です。
 
; [http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r.html Rでマイクロアレイデータ解析] : 東大アグリバイオインフォマティクスの門田先生による解説です。
 
==基礎論I (東京大学)==
 
; 授業資料 (上を参照)
 
 
===生物機能科学特別講義8 (山口大学)==
 
; 授業資料 (上を参照)
 
 
<!----
 
#貪欲アルゴリズム (ゲノムリアレンジメント、リバーサル)[笠原]
 
#動的計画法 (編集距離とアライメント、スコア行列)[笠原]
 
#動的計画法その2 (各種アライメント、最適化への応用)[笠原]
 
#分割統治法 (ブロックアライメント)[木立]
 
#グラフアルゴリズム (ハミルトン経路、タンパク質アラインメント)[笠原]
 
#組み合わせパターンマッチング (ハッシュ、接尾辞木、接尾辞行列)[笠原]
 
#クラスタリングと系統樹 (系統樹の構築と最適化の基準)[木立]
 
#隠れマルコフモデル (HMM,HMMアライメント)[木立]
 
#乱択アルゴリズム (ギブスサンプラー)[木立]
 
--->
 
 
==生命情報科学 (琉球大学)==
 
 
;評価方法
 
出席及び講義最後の簡単な筆記試験で評価します。
 

Latest revision as of 10:14, 16 November 2012

[edit] 生物情報科学

  • 計算と計算量
  1. ハノイの塔
  2. フィボナッチ数列O記法
  3. プログラミングの基礎
  4. 判定問題、計算可能性
  5. 停止問題
  • 配列解析、動的計画法
  1. 相同性
  2. アライメント (プログラム例)
  3. モチーフ探索
    1. (参考)制限酵素による切断
  • 進化系統樹、多重アライメント
  1. 多重アライメント
  2. 進化系統樹
  • タンパク質の構造、特徴
  1. タンパク質の構造
  2. タンパク質の構造予測
  • ネットワーク解析
  1. ランダムグラフ
  2. スケールフリー性

[edit] 関連サイト

統合TV 
統合データベースセンターが作成する、バイオインフォマティクスのビデオ講義です。ツールの使い方などが丁寧に解説されています。
Rでマイクロアレイデータ解析 
東大アグリバイオインフォマティクスの門田先生による解説です。
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