Aritalab:Lecture/Bioinformatics

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* 再帰関数 [[Aritalab:Lecture/Basic/Towers of Hanoi|ハノイの塔]]
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==生物情報科学==
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* 計算と計算量
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# [[Aritalab:Lecture/Algorithm/Towers of Hanoi|ハノイの塔]]
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# [[Aritalab:Lecture/Algorithm/Fibonacci|フィボナッチ数列]]、[[Aritalab:Lecture/Algorithm/BigO|O記法]]
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# [[Aritalab:Lecture/Programming|プログラミングの基礎]]
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# [[Aritalab:Lecture/Algorithm/NP|判定問題、計算可能性]]
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# [[Aritalab:Lecture/Algorithm/Halting_Problem|停止問題]]
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* 配列解析、動的計画法
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/Homology|相同性]]
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/Alignment|アライメント]] ([[Aritalab:Lecture/Programming/Java/Alignment|プログラム例]])
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/MotifFinding|モチーフ探索]]
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## (参考)[[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/PartialDigestion|制限酵素による切断]]
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* 進化系統樹、多重アライメント
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/MultipleAlignment|多重アライメント]]
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/Phylogeny|進化系統樹]]
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* タンパク質の構造、特徴
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# [[Aritalab:Lecture/Biochem/Protein|タンパク質の構造]]
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# [[Aritalab:Lecture/Bioinformatics/Protein|タンパク質の構造予測]]
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* ネットワーク解析
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# [[Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Erdos-Renyi_Model|ランダムグラフ]]
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# [[Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Barabasi-Albert_Model|スケールフリー性]]
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==関連サイト==
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; [http://togotv-curated.dbcls.jp/ 統合TV] : 統合データベースセンターが作成する、バイオインフォマティクスのビデオ講義です。ツールの使い方などが丁寧に解説されています。
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; [http://www.iu.a.u-tokyo.ac.jp/~kadota/r.html Rでマイクロアレイデータ解析] : 東大アグリバイオインフォマティクスの門田先生による解説です。

Latest revision as of 10:14, 16 November 2012

[edit] 生物情報科学

  • 計算と計算量
  1. ハノイの塔
  2. フィボナッチ数列O記法
  3. プログラミングの基礎
  4. 判定問題、計算可能性
  5. 停止問題
  • 配列解析、動的計画法
  1. 相同性
  2. アライメント (プログラム例)
  3. モチーフ探索
    1. (参考)制限酵素による切断
  • 進化系統樹、多重アライメント
  1. 多重アライメント
  2. 進化系統樹
  • タンパク質の構造、特徴
  1. タンパク質の構造
  2. タンパク質の構造予測
  • ネットワーク解析
  1. ランダムグラフ
  2. スケールフリー性

[edit] 関連サイト

統合TV 
統合データベースセンターが作成する、バイオインフォマティクスのビデオ講義です。ツールの使い方などが丁寧に解説されています。
Rでマイクロアレイデータ解析 
東大アグリバイオインフォマティクスの門田先生による解説です。
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