Aritalab:Lecture/Basic/Archaea
From Metabolomics.JP
< Aritalab:Lecture | Basic(Difference between revisions)
m |
m |
||
| Line 2: | Line 2: | ||
===Archaeaの起源=== | ===Archaeaの起源=== | ||
| − | + | 従来、Eocyte, Neomuran説のように真核生物がミトコンドリアを取り込んだという説と、古細菌がミトコンドリアを獲得したという説があった。真核生物はメタン生成菌とαプロテオバクテリアが融合して生まれてきたと考えられ<ref>Rivera MC, Lake JA (2004) The ring of life provides evidence for a genome fusion origin of eukaryotes. ''Nature'' 431(7005):152-5 PMID 15356622</ref>、メタン菌のヒストンと真核生物のヒストンの類似が根拠とされる<ref>Reeve J (2003) Archaeal chromatin and transcription. ''Mol Microbiol'' 48(3):587-98 PMID 12694606</ref>。 | |
| − | 古細菌は核もミトコンドリアも持たないが、真核生物なのにミトコンドリアも持たない変わり者たちをアーケゾア(Archaezoa) | + | 古細菌は核もミトコンドリアも持たないが、真核生物なのにミトコンドリアも持たない変わり者たちをアーケゾア(Archaezoa)と呼ぶ。アーケゾアでも核内にミトコンドリア由来の遺伝子を持ち、ミトコンドリア共生後に失ったと考えられている<ref>Keeling PJ (1998) A kingdom’s progress: Archezoa and the origin of eukaryotes. [http://www.botany.ubc.ca/keeling/PDF/98King.pdf ''Bioessays'' 20:87-95]</ref>。 |
| + | |||
| + | 最近 Archaezoa が細胞小器官 (hydrogenosome, mitosome) をもつことが判明。 | ||
| + | * Pyruvate より ATP を生産する hydrogenosome → trichomonads, chytridiomycetes, ciliates に見られ収斂進化？ | ||
| + | * mitosome → entamoeba, giardia, microsporidia | ||
;References | ;References | ||
| Line 13: | Line 17: | ||
==参考文献== | ==参考文献== | ||
| − | * 古細菌研究の歴史(レビュー) | + | * 古細菌研究の歴史(レビュー) Cavicchioli, R. (2010) Archaea - timeline of the third domain. Nature reviews, Microbiology 9, 51-61 |
| + | |||
| + | * Embley TM, Martin W "Eukaryotic evolution, changes and challenges" (review) ''Nature'' 440, 623-630 | ||
* 生物全体での系統樹 | * 生物全体での系統樹 | ||
| − | ** SSU rRNA | + | ** SSU rRNA (Pace, N.R. (2009) Mapping the tree of life: progress and prospects. Microbiology and molecular biology reviews : MMBR 73, 565-76) |
| − | ** Conserved Proteins | + | ** Conserved Proteins (Ciccarelli, F.D. et al. (2006) Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life. Science, 311, 1283-7) |
| − | * 配列比較以外の系統樹構築方法についての概説 | + | * 配列比較以外の系統樹構築方法についての概説 (Delsuc, F., Brinkmann, H. & Philippe, H. (2005) Phylogenomics and the reconstruction of the tree of life. Nature reviews. Genetics 6, 361-375) |
| − | * 16S rRNAをつかったアーキア系統樹で参考にした論文 | + | * 16S rRNAをつかったアーキア系統樹で参考にした論文 (Yarza, P. et al. (2008) The All-Species Living Tree project: a 16S rRNA-based phylogenetic tree of all sequenced type strains. Systematic and applied microbiology 31, 241-50) |
| − | + | ||
| − | + | ||
| − | + | ||
Revision as of 15:26, 26 May 2011
Contents |
古細菌の情報をまとめるページ
Archaeaの起源
従来、Eocyte, Neomuran説のように真核生物がミトコンドリアを取り込んだという説と、古細菌がミトコンドリアを獲得したという説があった。真核生物はメタン生成菌とαプロテオバクテリアが融合して生まれてきたと考えられ[1]、メタン菌のヒストンと真核生物のヒストンの類似が根拠とされる[2]。
古細菌は核もミトコンドリアも持たないが、真核生物なのにミトコンドリアも持たない変わり者たちをアーケゾア(Archaezoa)と呼ぶ。アーケゾアでも核内にミトコンドリア由来の遺伝子を持ち、ミトコンドリア共生後に失ったと考えられている[3]。
最近 Archaezoa が細胞小器官 (hydrogenosome, mitosome) をもつことが判明。
- Pyruvate より ATP を生産する hydrogenosome → trichomonads, chytridiomycetes, ciliates に見られ収斂進化？
- mitosome → entamoeba, giardia, microsporidia
- References
- ↑ Rivera MC, Lake JA (2004) The ring of life provides evidence for a genome fusion origin of eukaryotes. Nature 431(7005):152-5 PMID 15356622
- ↑ Reeve J (2003) Archaeal chromatin and transcription. Mol Microbiol 48(3):587-98 PMID 12694606
- ↑ Keeling PJ (1998) A kingdom’s progress: Archezoa and the origin of eukaryotes. Bioessays 20:87-95
ビデオレクチャー
参考文献
- 古細菌研究の歴史(レビュー) Cavicchioli, R. (2010) Archaea - timeline of the third domain. Nature reviews, Microbiology 9, 51-61
- Embley TM, Martin W "Eukaryotic evolution, changes and challenges" (review) Nature 440, 623-630
- 生物全体での系統樹
- SSU rRNA (Pace, N.R. (2009) Mapping the tree of life: progress and prospects. Microbiology and molecular biology reviews : MMBR 73, 565-76)
- Conserved Proteins (Ciccarelli, F.D. et al. (2006) Toward automatic reconstruction of a highly resolved tree of life. Science, 311, 1283-7)
- 配列比較以外の系統樹構築方法についての概説 (Delsuc, F., Brinkmann, H. & Philippe, H. (2005) Phylogenomics and the reconstruction of the tree of life. Nature reviews. Genetics 6, 361-375)
- 16S rRNAをつかったアーキア系統樹で参考にした論文 (Yarza, P. et al. (2008) The All-Species Living Tree project: a 16S rRNA-based phylogenetic tree of all sequenced type strains. Systematic and applied microbiology 31, 241-50)
