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| === 長谷川禎彦(Yoshihiko HASEGAWA)=== | | === 長谷川禎彦(Yoshihiko HASEGAWA)=== |
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− | Click [http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa here] for details.
| + | D取得後,無職になる寸前(25日前)に浅井先生,有田先生に拾ってもらいました.<br /> |
− | | + | これがなければ,今こうして研究者ではなかったでしょう・・・<br /> |
| + | 有田先生の研究スイートスポットは実に狭く,ほとんどの論文は駄目出しされたような気がします.<br /> |
| + | 長らく毛糸を針穴に通すような研究生活が続きました.<br /> |
| + | 入った時は「Protein」と言えばボディービルダーのご飯くらいのイメージしかなかった私ですが,<br /> |
| + | 6年間有田先生に鍛えられ生物系の論文も書けるようになり,<br /> |
| + | 最近の論文はそれなりにインパクトのある論文になったと思います.<br /> |
| + | やはり,「いいよいいよ」,「なぁなぁ」では良い論文は書けないのだと痛感しました.<br /> |
| + | 有田先生ほど常に本質を求める研究者もあまりいないと思います.<br /> |
| + | 物理的には別々の場所になりましたが,研究は今後も末永くお世話になると思います.<br /> |
| + | これを読んでいる学生や研究者で鍛えられたい方は是非有田研@遺伝研へ!<br /> |
| + | ちなみに私は,いでんしを扱う分野からでんし工学専攻という読み的には非常に近い分野に異動になりました.<br /> |
| 詳細は[http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa ここ]をクリックして下さい. | | 詳細は[http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa ここ]をクリックして下さい. |
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− | == 研究内容 ==
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− | === 遺伝子発現とノイズの関係 ===
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− | 遺伝子発現は,転写因子の濃度変化をタンパク質生成の形で応答する情報伝達機関である.<br>
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− | 遺伝子発現は非常に少ないコピー数での反応であるため,そのダイナミクスは様々なランダムノイズの影響を受ける.<br>
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− | 私の研究では,extrinsic noiseが遺伝子発現の情報伝達に及ぼす影響について,Langevin方程式(確率微分方程式)を用いて解析している.<br>
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− | これに関する出版文献は
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− | *[http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2010.11.007 Physica A 390, 1051 (2011)]
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− | 高次のゆらぎが遺伝子発現モデルに及ぼす影響を,ひとつの適用例として示した.
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− | === Superstatistical確率過程 ===
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− | Superstatisticsは示強変数(温度など)が揺らぐと過程した統計モデルであり<br>
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− | <math>P(\varepsilon)=\int d\beta P(\varepsilon | \beta)P(\beta),\;\;\;P(\varepsilon|\beta)=\frac{1}{Z}\exp(-\beta \varepsilon)</math><br>
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− | のようにモデルに階層性を持たせたモデルである.<math>P(\beta)</math>を事前分布,<math>P(\varepsilon)</math>を<br>
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− | を事後分布と考えると,ベイズ的なGibbs-Boltzmann統計と捉えることも出来る.<br>
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− | Langevin方程式(確率微分方程式)によるモデル化は,確率的な化学反応を伴う生体系に広範に用いられている.<br>
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− | 生体系では,環境は時間的な不均一性を持つため,これらの影響を考慮したモデルを用いる必要があると<br>
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− | 考えられる.SuperstatisticalなLangevin方程式における近似法,特徴量計算などを解析的・シミューレションによって行っている.<br>
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− | これに関する出版文献は<br>
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− | *[http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2010.07.001 Physica A 389, 4450 (2010)]<br>
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− | 環境が非常にゆっくり揺らぐ場合(つまり上のベイズ的な場合)の定常分布とMean first passage timeを求めた.
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− | *[http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2010.11.007 Physica A 390, 1051 (2011)]<br>
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− | 環境が速く揺らぐ場合の分布の時間発展方程式を断熱消去によって求め,4次微分を含む方程式となることを明らかとした.<br>
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− | さらに,定常分布を摂動展開によって計算した.
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− | *[http://arxiv.org/abs/1011.2533 arXiv:1011.2533]<br>
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− | 任意に速度で揺らぐ系における,定常分布,Mean first passage time,確率共鳴を計算した.<br>
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− | 対象の関数(固有関数や帯磁率)を直交完全系で展開することで求めた.
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| == 発表文献 == | | == 発表文献 == |
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| 詳細は[http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/publications ここ]をクリックして下さい. | | 詳細は[http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/publications ここ]をクリックして下さい. |
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− | === Preprints ===
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Brownian Motors Driven by Noise Intensity Fluctuation (arXiv:1112.5287)
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Entrainability Enhancement by Period Mismatch in Biloop Genetic Oscillators (arXiv:1206:6238)
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− | === Journal Papers ===
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Escape Process and Stochastic Resonance Under Noise-Intensity Fluctuation, Physics Letters A, vol.375, p.3450-3458, 2011 (arXiv:1011.2533)
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Noise-Intensity Fluctuation in Langevin Model and Its Higher-order Fokker-Planck Equation, Physica A, vol.390, p.1051-1063, 2011 (arXiv:1004.1252)
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Bistable Stochastic Processes in the q-Exponential Family, Physica A, vol.389, p.4450-4461, 2010 (arXiv:1004.1452)
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− | * 柳瀬 利彦 '''長谷川 禎彦''' 伊庭斉志.確率モデルGPのための二分岐化プロトタイプ木,人工知能学会論文誌25巻2号,p340-350,2010
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Masanori Arita. Properties of the Maximum q-Likelihood Estimator for Independent Random Variables, Physica A, vol.388, p.3399-3412, 2009
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Hitoshi Iba. Latent Variable Model for Estimation of Distribution Algorithm Based on a Probabilistic Context-Free Grammar, IEEE Transactions on Evolutionary Computation, Vol.13, Issue 4, p.858-878, 2009
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− | * '''長谷川禎彦''' 伊庭斉志.PCFG-LA混合モデルに基づく分布推定アルゴリズム,人工知能学会論文誌24巻1号,p.80-91,2009
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− | * '''Yoshihiko Hasegawa''' and Hitoshi Iba. A Bayesian Network Approach to Program Generation, IEEE Transactions on Evolutionary Computation, Vol.12, Issue 6, p.750-764, 2008
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− | * '''長谷川禎彦''' 伊庭斉志.潜在アノテーション推定を用いた確率文法による分布推定アルゴリズム,人工知能学会論文誌23巻1号,p.13-26,2008
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− | * '''長谷川禎彦''' 伊庭斉志.ベイジアンネットワーク推定による確率モデル遺伝的プログラミング,人工知能学会論文誌22巻1号,p.37-47,2007
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− | * '''長谷川禎彦''' 伊庭斉志.免疫系を用いた遺伝的プログラミングによる多峰性探索,人工知能学会論文誌21巻2号,p.176-183,2006
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| == プログラム == | | == プログラム == |
| * ''q''正規分布に従う乱数生成プログラム([http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/programs ここ]). | | * ''q''正規分布に従う乱数生成プログラム([http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/programs ここ]). |
| * Javaによる遺伝的プログラミングの実装([http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/genetic-programming ここ]). | | * Javaによる遺伝的プログラミングの実装([http://sites.google.com/site/yoshihikohasegawa/genetic-programming ここ]). |