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有田正規 (ありたまさのり)

部局: 東京大学 大学院理学系研究科
専攻: 生物化学
職: 准教授
住所: 113-0033 文京区本郷7-3-1 東大・理・生物化学 有田研究室(理学部3号館301)
Tel/Fax: ともに 03-5841-0764

Research

  • DNAコンピュータ(平成8~14年度)
    平成8年日本で初めてDNA計算の実験を行い、主にその後のDNA計算分野の基礎となる配列設計問題に取り組みました。テンプレート法と名づけた配列設計法はNew Generation Computing Award (2002)を受賞し、産業技術総合研究所標準計測部門における標準DNAの設計に利用されました。
  • 情報媒体としてのDNA(平成14~16年度)
    DNA内に人為情報を記録する手法を複数発表し、Handbook of Natural Computing(発刊予定)では”in vivo DNA memory”を担当しました。
  • 代謝ネットワークの電子化(平成13~現在)
    代謝ネットワークを原子レベルで表現し、各原子をトレース可能なソフトウェアを構築しました。
  • Wikiを用いたデータベース設計(平成17~現在)
    Wikiソフトウェアに検索コマンドを組み込むことでデータベースとして機能させることに成功した。この機能を用いてフラボノイドの網羅的なデータベースを設計、公開。この機能を活かして様々な分野の融合を試みています。この仕組みは日本脂質生化学会、日本質量分析学会の公式データベースに利用されます。

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