User:Aritalab/Masanori Arita

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* DNAコンピュータ(平成8~14年度)<br/>平成8年日本で初めてDNA計算の実験を行い、主にその後のDNA計算分野の基礎となる配列設計問題に取り組みました。テンプレート法と名づけた配列設計法はNew Generation Computing Award (2002)を受賞し、産業技術総合研究所標準計測部門における標準DNAの設計に利用されました。
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* 情報媒体としてのDNA(平成14~16年度)<br/>DNA内に人為情報を記録する手法を複数発表し、Handbook of Natural Computing(発刊予定)では”in vivo DNA memory”を担当しました。
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* 代謝ネットワークの電子化(平成13~現在)<br/>代謝ネットワークを原子レベルで表現し、各原子をトレース可能なソフトウェアを構築しました。研究目的だけでなく教育にも使われるソフトウェアとして現在もフィンランド、米国等にユーザが存在します。
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* Wikiを用いたデータベース設計(平成17~現在)<br/>Wikiソフトウェアに検索コマンドを組み込むことでデータベースとして機能させることに成功した。この機能を用いてフラボノイドの網羅的なデータベースを設計、公開。この機能を活かして様々な分野の融合を試みています。この仕組みは日本脂質生化学会、日本質量分析学会の公式データベースに利用されます。
  
 
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* [[Aritalab:Lecture/NetworkBiology|ネットワーク生物学 Network Biology]]
 
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Revision as of 01:33, 16 November 2010

Contents

Profile

Research

  • DNAコンピュータ(平成8~14年度)
    平成8年日本で初めてDNA計算の実験を行い、主にその後のDNA計算分野の基礎となる配列設計問題に取り組みました。テンプレート法と名づけた配列設計法はNew Generation Computing Award (2002)を受賞し、産業技術総合研究所標準計測部門における標準DNAの設計に利用されました。
  • 情報媒体としてのDNA(平成14~16年度)
    DNA内に人為情報を記録する手法を複数発表し、Handbook of Natural Computing(発刊予定)では”in vivo DNA memory”を担当しました。
  • 代謝ネットワークの電子化(平成13~現在)
    代謝ネットワークを原子レベルで表現し、各原子をトレース可能なソフトウェアを構築しました。研究目的だけでなく教育にも使われるソフトウェアとして現在もフィンランド、米国等にユーザが存在します。
  • Wikiを用いたデータベース設計(平成17~現在)
    Wikiソフトウェアに検索コマンドを組み込むことでデータベースとして機能させることに成功した。この機能を用いてフラボノイドの網羅的なデータベースを設計、公開。この機能を活かして様々な分野の融合を試みています。この仕組みは日本脂質生化学会、日本質量分析学会の公式データベースに利用されます。

Lecture Materials

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