Aritalab:Lecture/Biophysics/Molecule

小さなイオン

生体に重要なイオンは H₃O⁺, Na⁺, K⁺, Mg²⁺, Ca²⁺, NH4⁺, OH^-, Cl^-, SO4^2-, PO4^3-, CH3COO^-などです。こうしたイオンは生体分子の帯電部分に対イオンとして対合します。ただその位置が固定されているわけではありません。まれに固定されている場合はX線結晶解析の結果として位置がわかります。酸と塩基は pH に従って乖離し、ときに緩衝液として機能します。

塩基と補酵素

NTP は三リン酸のため、ポリリン酸基部分に4つまで (0 ∼ -4) 電荷を持ちえます。

生体内で還元力を持つ補酵素は NADH と NADPH で、リン酸基部分で連結された２塩基、アデニンとニコチンアミド、からなります。細胞内の酸化還元状態は NAD+/NADH 比で表されます。植物では光合成によりNADP+がNADPHに戻ります。

ヘムやクロロフィルは補欠分子族（タンパク質に結合する非タンパク性の小分子）の１つで、結合するタンパク質があります。それぞれポルフィリン環の中央に鉄かマグネシウムイオンが配位しており、まわりの窒素原子とは結合手がはっきりしない平面状態をとっています。（クロロフィルには炭化水素の尻尾もあります。）