Aritalab:Lecture/Bioinformatics
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４年生の人で卒業単位の判定が２月上旬になる場合、以下の問題を解いたレポートを有田まで送ってください。単位の判定に間に合うように成績を評価します。 | ４年生の人で卒業単位の判定が２月上旬になる場合、以下の問題を解いたレポートを有田まで送ってください。単位の判定に間に合うように成績を評価します。 | ||
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Revision as of 14:47, 3 October 2011
Contents |
生物情報学
基礎論I
- 【授業計画】 各回の主テーマと、カッコ内に具体的なトピックを記します。
- ガイダンス （バイオインフォマティクスとは何か）
- アルゴリズムと計算量 （計算量の記法、アルゴリズムの定義）
分子生物学の基礎 （配列情報と生物学の関係）- 全解探索 （制限酵素マッピング、モチーフ探索）
教科書にある全解探索の見積もり方法を理解しておきましょう。
教科書
“An Introduction to Bioinformatics Algorithms” Jones and Pevzner (MIT Press) 「バイオインフォマティクスのためのアルゴリズム入門」 Jones and Pevzner（著）、渋谷・坂内（訳）共立出版
評価方法
出席及び筆記試験。試験問題は授業を担当する各先生が作成します。
- 有田部分は、テキストに載っている簡単な事項に加え、授業内で解説した本ウェブサイト上の内容から出題します。ただし、Cookの定理の詳細と、授業で説明していないのにウェブ上で説明されている事項（例えばチューリング機械の等価性）に関する出題はありません。
