User:Aritalab/Kazuhiro Takemoto
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バイオインフォマティクスやネットワーク理論といった情報数理的な観点から、生物系に対する統合的な理解を目指しています。特に、代謝系（代謝ネットワーク）について注目して研究を行っています。生物は、長い進化過程において代謝系を変化させることでさまざまな代謝物を合成し、環境に適応してきました。このような代謝物組成の決定や代謝経路の形成に働く原理を明らかにすることは、適応進化の理解や生命現象の制御において重要です。生物の環境適応という視点から、データ解析を通して代謝物多様性と代謝ネットワーク形成に対する統合的な数理モデルを構築し、有用な生産物の人工合成などに応用したいと考えています。 | バイオインフォマティクスやネットワーク理論といった情報数理的な観点から、生物系に対する統合的な理解を目指しています。特に、代謝系（代謝ネットワーク）について注目して研究を行っています。生物は、長い進化過程において代謝系を変化させることでさまざまな代謝物を合成し、環境に適応してきました。このような代謝物組成の決定や代謝経路の形成に働く原理を明らかにすることは、適応進化の理解や生命現象の制御において重要です。生物の環境適応という視点から、データ解析を通して代謝物多様性と代謝ネットワーク形成に対する統合的な数理モデルを構築し、有用な生産物の人工合成などに応用したいと考えています。 | ||
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* Takemoto, K. and Arita, M. [http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2009.03.011 '''Heterogeneous distribution of metabolites across plant species.'''] ''Physica A'' '''388''', 2771 (2009). | * Takemoto, K. and Arita, M. [http://dx.doi.org/10.1016/j.physa.2009.03.011 '''Heterogeneous distribution of metabolites across plant species.'''] ''Physica A'' '''388''', 2771 (2009). | ||
* Takemoto, K. [http://dx.doi.org/10.1016/j.biosystems.2009.12.002 '''Global architecture of metabolite distributions across species and its formation mechanisms.'''] ''Biosystems'' '''100''', 8 (2010). | * Takemoto, K. [http://dx.doi.org/10.1016/j.biosystems.2009.12.002 '''Global architecture of metabolite distributions across species and its formation mechanisms.'''] ''Biosystems'' '''100''', 8 (2010). | ||
上の論文ではMetabolomics.JPにおけるデータベース[[:Category:FL|'''FLavonoids''']]と[[Index:PS|'''Plants''']]を利用しました。 | 上の論文ではMetabolomics.JPにおけるデータベース[[:Category:FL|'''FLavonoids''']]と[[Index:PS|'''Plants''']]を利用しました。 | ||
Revision as of 15:24, 7 October 2011
竹本 和広 (TAKEMOTO, Kazuhiro)
詳細はこちらのHPをご覧下さい。 See this site for details.
研究概要
バイオインフォマティクスやネットワーク理論といった情報数理的な観点から、生物系に対する統合的な理解を目指しています。特に、代謝系（代謝ネットワーク）について注目して研究を行っています。生物は、長い進化過程において代謝系を変化させることでさまざまな代謝物を合成し、環境に適応してきました。このような代謝物組成の決定や代謝経路の形成に働く原理を明らかにすることは、適応進化の理解や生命現象の制御において重要です。生物の環境適応という視点から、データ解析を通して代謝物多様性と代謝ネットワーク形成に対する統合的な数理モデルを構築し、有用な生産物の人工合成などに応用したいと考えています。
より具体的にはこちらのページをご参考ください。これまでの研究を概説しています。
参考文献
- 竹本和広. 代謝ネットワーク形成の理解に向けて. 細胞を創る・生命システムを創る (実験医学増刊29巻7号), 羊土社, 180 (2011).
- Takemoto, K. and Oosawa, C. Modeling for evolving biological networks. In Machine Learning Approach for Network Analysis: Novel Graph Classes and Classification Techniques (ed. Dehmer, M.), John Wiley & Sons, to appear. (出版はもう少し先ですので、読みたい方は竹本にご連絡ください)
より多くの文献はこちらでご覧になれます。
Metabolomics.JP関連の業績
- Metabolomics.JPのロゴ作成 :) ロゴ（EPS形式）はここからダウンロードできます。
- Takemoto, K. and Arita, M. Heterogeneous distribution of metabolites across plant species. Physica A 388, 2771 (2009).
- Takemoto, K. Global architecture of metabolite distributions across species and its formation mechanisms. Biosystems 100, 8 (2010).
上の論文ではMetabolomics.JPにおけるデータベースFLavonoidsとPlantsを利用しました。
