Aritalab:Lecture/SystemsBiology

システム生物学概論

概要

オーム研究とも呼ばれる網羅的な実験結果を処理するための、統計的、グラフ論的手法について簡単に解説します。特に、遺伝子や代謝のネットワーク解析、ネットワークモチーフなど、「生命をシステムとして理解する」という概念やアプローチを紹介します。

授業内容

• 5/26 ネットワーク解析: スケールフリー（べき分布）と優先的選択メカニズムの関係、GoogleにおけるPageRankの求め方について学習します
  • スケールフリーネットワーク
  • リンク解析、ページランク
  • ネットワーク用ソフトウェア
• 6/2 代謝のネットワーク、メタボロミクス: 代謝物の測定法と、代表的な解析法について学習します
  • 代謝物の抽出
  • 代謝物の測定
• 6/9 タンパク質のネットワーク、プロテオミクス: タンパク質と代謝の解析法の違い、
• 6/16 システム生物学、シミュレーションと合成生物学: 生体シミュレーションツールにより計算される内容と、生命現象を再構築するアプローチとして、計算機を使った場合（シミュレーション）と、生物実験による場合（合成生物学）について学習します