Doc:Polyamine - Revision history

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Adm: New page: ==定義== ポリアミンはアミノ基を多く含む塩基性非環状低分子化合物の総称。細胞内では濃度が厳密に調節されています。 {| class="wikitable" !...

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New page: ==定義== ポリアミンはアミノ基を多く含む塩基性非環状低分子化合物の総称。細胞内では濃度が厳密に調節されています。 {| class="wikitable" !...

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==定義==
ポリアミンはアミノ基を多く含む塩基性非環状低分子化合物の総称。細胞内では濃度が厳密に調節されています。

{| class="wikitable"
! 標準ポリアミン
| プトレシン、スペルミジン、スペルミン
| 細菌からカビ、高等真核生物まで
|-
! 長鎖ポリアミン
| カルドペンタミン、カルドヘキサミン
| 高度好熱菌 (''Thermus thermophilus, Thermococcus kodakarensis'')
|-
! 分岐ポリアミン
| テトラキス(3－アミノプロピル)アンモニア
| 高度好熱菌 (''Thermus thermophilus, Pyrococcus kodakarensis'')
|}
* :

長鎖ポリアミンDNA, RNAのステム等二重鎖構造、分岐ポリアミンはループ構造を安定させると考えられている<ref name="">Terui Y, Ohnuma M, Hiraga K, Kawashima K, Oshima T (2005) Stabilization of nucleic acids by unusual polyamines produced by an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus Biochem J'' 388, 427-433 [http://www.biochemj.org/bj/388/bj3880427.htm PDF]</ref>。

==生合成==
===多くの生物で見られる合成系===
{|
|
|
| L-arginine
|-
|
|
|
{|
| [[Image:br/Arrow00d35.png]]
| arginine decarboxylase
|}
|-
| L-ornithine
|
| agmatine
|-
|
{|
| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
| ornithine decarboxylase (most eukaryotes)
|}
|
|
{|
| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
| agmatine ureohydrolase (plants and some bacteria)
|}
|-
|
| putrescine
|
|-
|
|
| spermidine
|}

===好熱菌の合成系===

{|
|
| L-arginine
|
|-
| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
|
| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
|-
| aminopropyl agmatine <ref>Ohnuma M, Terui Y, Tamakoshi M, Mitome H, Niitsu M, Samejima K, Kwashima E, Ohshima T (2005) N1-aminopropylagmatine, a new polyamine produced as a key intermediate in polyamine biosynthesis of an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus J Biol Chem'' 280, 30073-30082</ref>
|
| putrescine
|-
| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
|
| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
|-
|
| spermidine
|
|-
|
| spermine
|
|}

<references/>

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 ==定義==
-ポリアミンはアミノ基を多く含む塩基性非環状低分子化合物の総称。細胞内では濃度が厳密に調節されています。
+ポリアミンはアミノ基を多く含む塩基性非環状低分子化合物の総称です。
 {| class="wikitable"
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 <sup>*</sup> ... ''Thermus thermophilus, Thermococcus kodakarensis, Pyrococcus furiosus''
-長鎖ポリアミンDNA, RNAのステム等二重鎖構造、分岐ポリアミンはループ構造を安定させると考えられている<ref name="ohshima05">Terui Y, Ohnuma M, Hiraga K, Kawashima K, Oshima T (2005) Stabilization of nucleic acids by unusual polyamines produced by an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus Biochem J'' 388, 427-433 [http://www.biochemj.org/bj/388/bj3880427.htm PDF]</ref>。
+;References
 ==生合成==
 ===多くの生物で見られる合成系===
-{|
+{| style="text-align:center"
+|
+|
-| L-arginine
+| L-<big>arginine</big>
 |-
+|
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+|
 {|
-| [[Image:br/Arrow00d35.png]]
+| <small>arginine<br/>decarboxylase</small>
-| <small>arginine decarboxylase</small>
+| [[Image:Arrow00d35.png]]
 |}
 |-
-| L-ornithine
+| L-<big>ornithine</big>
+|
-| agmatine
+| <big>agmatine<big>
 |-
+|
 {|
-| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
+| <small>ornithine<br/>decarboxylase<br/>(most eukaryotes)</small>
-| <small>ornithine decarboxylase (most eukaryotes)</small>
+| [[Image:Arrow00dr35.png]]
 |}
+|
+|
 {|
-| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
+| [[Image:Arrow00dl35.png]]
-| <small>agmatine ureohydrolase (plants and some bacteria)</small>
+| <small>agmatine<br/>ureohydrolase<br/>(plants and some bacteria)</small>
 |}
 |-
+|
-| putrescine
+| <big>putrescine</big>
+|
 |-
+|
+|
-| spermidine
+|-
 |}
 ===好熱菌の合成系===
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 {|
+|
-| L-arginine
+| L-<big>arginine</big>
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 |-
-| [[Image:br/Arrow00dl35.png]] Pathway II
+| Pathway II [[Image:Arrow00dl35.png]]
+|
-| [[Image:br/Arrow00dr35.png]] Pathway I
+| [[Image:Arrow00dr35.png]] Pathway I
 |-
-| aminopropyl agmatine <ref name="adams07">Cacciapuoti G, Porcelli M, Moretti MA, Sorrentino F, ..., Adams MW. (2007) The first agmatine/cadaverine
+| <big>aminopropyl<br/>agmatine</big> <ref name="adams07">Cacciapuoti G, Porcelli M, Moretti MA, Sorrentino F, ..., Adams MW. (2007) The first agmatine/cadaverine
 aminopropyl transferase: biochemical and structural characterization
 of an enzyme involved in polyamine biosynthesis in the hyperthermophilic
 archaeon ''Pyrococcus furiosus''. ''J Bacteriol'' 189, 6057–6067</ref><ref name="ohshima05b">Ohnuma M, Terui Y, Tamakoshi M, Mitome H, Niitsu M, Samejima K, Kwashima E, Ohshima T (2005) N1-aminopropylagmatine, a new polyamine produced as a key intermediate in polyamine biosynthesis of an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus.'' ''J Biol Chem'' 280, 30073-30082</ref><ref name="fujiwara10">Morimoto N, Fukuda W, Nakajima N, Masuda T, ..., Imanaka T, Fujiwara S (2010) Dual Biosynthesis Pathway for Longer-Chain Polyamines in the Hyperthermophilic Archaeon ''Thermococcus kodakarensis.'' ''J Bacteriol'' 192, 4991-5001</ref>
+|
-| putrescine
+| <big>putrescine</big>
 |-
-| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
+|align="right"| [[Image:Arrow00dr35.png]]
+|
-| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
+| [[Image:Arrow00dl35.png]]
 |-
+|
-| spermidine
+| <big>spermidine</big>
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 |-
+|
-| spermine
+| <big>spermine</big>
+|
 |}
-好熱菌ではプトレシンの生合成を阻害してもポリアミン量に変化は見られないのに対し、SAM decarboxylase を阻害してaminopropyl agmatineの合成を阻害するとポリアミンを合成しない。Pathway IIがスペルミン合成の主要経路と考えられる。
+好熱菌ではプトレシンの生合成を阻害してもポリアミン量に変化は見られないのに対し、SAM decarboxylase を阻害してaminopropyl agmatineの合成を阻害するとポリアミンを合成しません。Pathway IIがスペルミン合成の主要経路と考えられます。
 <references/>

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 |}
-好熱菌ではプトレシンの生合成を阻害してもポリアミン量に変化は見られず、Pathway IIがスペルミン合成の主要経路になる。
+好熱菌ではプトレシンの生合成を阻害してもポリアミン量に変化は見られないのに対し、SAM decarboxylase を阻害してaminopropyl agmatineの合成を阻害するとポリアミンを合成しない。Pathway IIがスペルミン合成の主要経路と考えられる。
 <references/>

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 ! 長鎖ポリアミン
 | カルドペンタミン、カルドヘキサミン
-| 高度好熱菌 (''Thermus thermophilus, Thermococcus kodakarensis'')
+| 高度好熱菌<sup>*</sup>
 |-
 ! 分岐ポリアミン
 | テトラキス(3－アミノプロピル)アンモニア
-| 高度好熱菌 (''Thermus thermophilus, Pyrococcus kodakarensis'')
+| 高度好熱菌<sup>*</sup>
 |}
-* :
+<sup>*</sup> ... ''Thermus thermophilus, Thermococcus kodakarensis, Pyrococcus furiosus''
 長鎖ポリアミンDNA, RNAのステム等二重鎖構造、分岐ポリアミンはループ構造を安定させると考えられている<ref name="">Terui Y, Ohnuma M, Hiraga K, Kawashima K, Oshima T (2005) Stabilization of nucleic acids by unusual polyamines produced by an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus Biochem J'' 388, 427-433 [http://www.biochemj.org/bj/388/bj3880427.htm PDF]</ref>。
 ==生合成==
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 {|
 | [[Image:br/Arrow00d35.png]]
-| arginine decarboxylase
+| <small>arginine decarboxylase</small>
 |}
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 {|
 | [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
-| ornithine decarboxylase (most eukaryotes)
+| <small>ornithine decarboxylase (most eukaryotes)</small>
 |}
+|
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 {|
 | [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
-| agmatine ureohydrolase (plants and some bacteria)
+| <small>agmatine ureohydrolase (plants and some bacteria)</small>
 |}
 |-
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+|
 |-
-| [[Image:br/Arrow00dl35.png]]
+| [[Image:br/Arrow00dl35.png]] Pathway II
+|
-| [[Image:br/Arrow00dr35.png]]
+| [[Image:br/Arrow00dr35.png]] Pathway I
 |-
-| aminopropyl agmatine <ref>Ohnuma M, Terui Y, Tamakoshi M, Mitome H, Niitsu M, Samejima K, Kwashima E, Ohshima T (2005) N1-aminopropylagmatine, a new polyamine produced as a key intermediate in polyamine biosynthesis of an extreme thermophile, ''Thermus thermophilus J Biol Chem'' 280, 30073-30082</ref>
+| aminopropyl agmatine <ref name="adams07">Cacciapuoti G, Porcelli M, Moretti MA, Sorrentino F, ..., Adams MW. (2007) The first agmatine/cadaverine
+|
 | putrescine
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+|
 |}
 <references/>