Adm at 01:29, 19 October 2011

2011-10-19T01:29:22Z

Adm: Created page with "==Inbreeding== 遺伝子の優性アレル A と劣性アレル a の交配パターンをモデルしましょう。アレルを A, a で表すと、遺伝型は AA, Aa, aa の..."

2011-10-18T07:54:13Z

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==Inbreeding==

遺伝子の優性アレル A と劣性アレル a の交配パターンをモデルしましょう。アレルを A, a で表すと、遺伝型は AA, Aa, aa の 3 通り、交配パターンは AA × AA, AA × Aa, Aa × Aa, AA × aa, Aa × aa, aa × aa の 6 通りあります。親子のアレルパターンを行列であらわすと以下のようになります。

* 親が AA × AA の場合、子供は必ず AA なので、子供どうしのかけ合わせも AA × AA
* 親が AA × Aa の場合、子供は確率 1/2, 1/2 で AA, Aa なので、子供のかけ合わせは AA × AA, AA × Aa, Aa × Aa
* 親が Aa × Aa の場合、子供は確率 1/4, 1/2, 1/4 で AA, Aa, aa なので、子供のかけ合わせは全パターンが生じる
* 親が Aa × aa の場合、子供は確率 1/2 で Aa, aa なので、子供のかけ合わせは Aa × Aa, Aa × aa, aa × aa
* 親が AA × aa の場合、子供は必ず Aa なので、子供どうしのかけ合わせは Aa × Aa
* 親が aa × aa の場合、子供は必ず aa なので、子供どうしのかけ合わせも aa × aa

{| class="wikitable" style="text-align:center"
!
! colspan = "6" | children
|-
! parents ↓ || AA × AA || AA × Aa || Aa × Aa || Aa × aa || AA × aa || aa × aa
|-
! AA × AA
| 1 || 0 || 0 || 0 || 0 || 0
|-
! AA × Aa
| 0
|style="color:red"| 1/2
|style="color:red"| 1/4
|style="color:red"| 1/2
|style="color:red"| 0 || 0
|-
! Aa × Aa
| 1/16
|style="color:red"| 1/4
|style="color:red"| 1/4
|style="color:red"| 1/4
|style="color:red"| 1/8 || 1/16
|-
! Aa × aa
| 0
|style="color:red"| 0
|style="color:red"| 1/4
|style="color:red"| 1/2
|style="color:red"| 0 || 1/4
|-
! AA × aa
| 0
|style="color:red"| 0
|style="color:red"| 1
|style="color:red"| 0
|style="color:red"| 0 || 0
|-
! aa × aa
| 0 || 0 || 0 || 0 || 0 || 1
|}

これは 6 状態のマルコフ連鎖で、AA &; AA と aa × aa が吸収状態になっています。真ん中の赤で示した 4 × 4 行列（ T と書きましょう）は過渡的状態で、<math>\lim T^n = 0</math> です。

@@ Line 11: / Line 11: @@
 {| class="wikitable" style="text-align:center"
+! 確率行列 '''P'''
 ! colspan = "6" | children
 |-
@@ Line 17: / Line 17: @@
 |-
 ! AA &times; AA
-| 1 || 0 || 0 || 0 || 0 || 0
+| 1
 |-
 ! AA &times; Aa
-| 0
+|style="background:lightgray"| 1/4
 |style="color:red"| 1/2
 |style="color:red"| 1/4
-|style="color:red"| 1/2
+|style="color:red"| 0
-|style="color:red"| 0 || 0
+|style="color:red"| 0
 |-
 ! Aa &times; Aa
-| 1/16
+|style="background:lightgray"| 1/16
 |style="color:red"| 1/4
 |style="color:red"| 1/4
 |style="color:red"| 1/4
-|style="color:red"| 1/8 || 1/16
+|style="color:red"| 1/8
 |-
 ! Aa &times; aa
-| 0
+|style="background:lightgray"| 0
 |style="color:red"| 0
 |style="color:red"| 1/4
 |style="color:red"| 1/2
-|style="color:red"| 0 || 1/4
+|style="color:red"| 0
 |-
 ! AA &times; aa
-| 0
+|style="background:lightgray"| 0
 |style="color:red"| 0
 |style="color:red"| 1
 |style="color:red"| 0
-|style="color:red"| 0 || 0
+|style="color:red"| 0
 |-
 ! aa &times; aa
-| 0 || 0 || 0 || 0 || 0 || 1
+| 0
-|}
+|style="background:lightgray"| 0
-これは 6 状態のマルコフ連鎖で、AA &; AA と aa &times; aa が吸収状態になっています。真ん中の赤で示した 4 &times; 4 行列（ T と書きましょう）は過渡的状態で、<math>\lim T^n = 0</math> です。
+<math>

Aritalab:Lecture/NetworkBiology/Markov Chains/Genetics - Revision history

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